物理实验中心在新校区第一教学区文理楼和B区共有42间房间，文理楼8个房间，B区34个房间,面积为4079.5平方米。其中物理实验室36间，面积3502平方米；中级物理实验室4间，面积为354.3平方米；数学建模实验中心2间，面积为223.2平方米。基础实验中心现有人员12人，其中副教授1人，高级实验室1人，工程师7人，助教3人。

物理实验中心参与的科研项目有船—岸安全电气连接新技术研究和上海市教委集成电路氧化绝缘层静电击穿模型研究；获得的科技奖有生成亚倒替防静电绝缘材料的方法，上海市第十九届优秀发明选拔赛二等奖；船-岸安全电气连接新技术，2004年度上海市科技进步奖三等奖。出版的主要着作有电磁兼容性与抗干扰技术，Recent Developments in Applied Electrostatics。发表的论文被SCI、EI、SCIE、ISTP收录共5篇。

物理实验中心下设机构有物理实验室和数学建模实验室，主要任务是完成全校理工科学生的大学物理实验教学；电磁场与微波技术专业研究生实验教学。

上海海事大学基础物理实验中心承担学校本科教学基础实验教学任务。主要仪器设备有杨氏模量仪、转动惯量仪、稳压电源、滑线式惠斯登电桥、箱式惠斯登电桥、滑 线式电位差计、声速测量仪、信号发生器、双踪示波器、读数显微镜、分光计、光学平台、霍尔效应仪、迈克尔逊干涉仪、激光器、电脑、密立根油滴仪、玻尔共振 仪、旋转液体测量仪、比热容比测定仪、夫兰克赫兹实验仪、光速测定仪、金属逸出功测定仪、传感器实验台、荷质比测定仪、存储示波器、微波检测仪、超声探伤 仪、大型混沌摆、云雾室、高温超导特性测高试装置、静电除尘除雾、微波技术等，可以面向本科生开出近30个实验项目，为电磁场与微波技术专业研究生开出近10个微波技术实验项目。物理实验是上海教委重点课程、曾经获得过上海海事大学教学成果三等奖，上海海事大学三八先进集体，上海海事大学文明科室。