科技处（科技研究发展部）是在校长(或分管副校长)领导下，负责全校学科建设、科技项目管理、科技成果管理、知识产权管理、学术交流、科技成果转化、科技服务管理等日常组织管理机构，实行校院（部门）两级科研管理，其主要职责如下：
一、根据国家科技方针、政策、教育改革、学科建设和师资队伍建设的要求，组织编制全校科学研究的长远规划和年度计划。
二、根据学校科技工作重点发展方向，管理科技队伍建设和科研机构建设等。
三、组织督促学院（部门）科学研究年度计划的实施，定期检查计划执行情况，及时总结、推广科研工作中的先进经验，研究和掌握科技工作中倾向性问题，及时提出改进意见，供校领导决策。
四、按质量体系的要求，制订科学研究的各项管理制度文件。做好科技项目管理（项目申报、项目评审、项目立项、中期检查、经费管理和结题验收等），科技成果管理（成果鉴定、评奖和专利申请等），科技成果转化与推广，科技服务管理（项目洽谈、合同签订和组织实施）等工作。
五、负责学科建设和研究基地管理，提出学校学科建设的发展规划，组织国家、部市级重点学科和研究基地的审查、上报、评审、检查和验收等工作。
六、负责我校主办的国内外学术交流活动的组织报批等准备工作；全校的学术交流、对外的对口交流及资料的归口管理工作等。
七、负责国内外各种学会、协会以及与外单位建立科技交流关系等组织联络工作。做好国际交流科技资料的保密审查。
八、负责产学研联盟的开拓，组织参加各种科技交易会、洽谈会、展览会等技术市场活动等。
九、协助学校有关部门，负责对学院以及教师进行科技工作的考核、工作量计算、评优表彰等工作。
十、负责教育部、交通运输部等科技统计年报的编写和上报；协助学校有关部门，编写“上海海事大学统计年鉴（学科建设与科学研究）。
十一、按质量体系要求，协助信息化办公室推进办公自动化和科技管理信息化等工作。